圣安多尼旧堂的现址建于一五五八年，与今日的安多尼堂位置相同，且是澳门的第一间小教堂。
教堂的历史间略载于教堂大门侧的一块石碑上，内容是：“兴建于一六三八年，一八零九年被焚毁，一八一零年重建，一八七四年再次被焚毁，一八七五年重修”，而在这教堂前地还有一个刻上一六三六年的十字架，于一九三零年再次被焚毁，亦再次被修葺，但外墙及钟楼的工程却于一九四零年才进行，圣安多尼是葡国军队的军人，其官衔为“上尉”。
每年在庆祝圣安多尼节的当天，即六月十三日，都会举行由市政府主席主持有关军薪俸奉献给圣人的仪式，更举行圣像游行。